【万能求助】核酸检测误诊可能,概率论以及贝叶斯公式(原创)
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作者:漫漫长路 (等级:2 - 初出茅庐,发帖:43) 发表:2021-11-11 12:23:54  楼主  关注此帖评分:
【万能求助】核酸检测误诊可能,概率论以及贝叶斯公式(原创)
原创文章,理性讨论,不抬杠不撕逼。 

太长不看版:
1.新加坡眼app提到4例PCR疑似假阳,都来自来福士诊所。
2.贝叶斯公式证明如果新加坡普查, 一个人PCR阳性但真正得病的概率为0.44
3.如果怀疑自己PCR假阳,应该怎么办?


1. 4例PCR疑似假阳,都来自来福士诊所,血清全部呈现阴性。

有网友收到PCR阳性,当天马上去再测一次变阴。 阴变阳有可能是后来得的, 阳变阴逻辑上证明误诊可能,尤其是在这么短的时间内再测,有人还不止测了一次。4例都是来福士,应当引起注意了。


2. 贝叶斯公式以及误诊概率

新加坡总人口545万(2021年6月公开数据),新冠总确诊数227681(2021/11/11新浪数据),所以估计目前患病比例为0.04.  以事件A表示PCR呈现阳性,以A’表示PCR呈现阴性(事件A的补集).  PCR检测准确率数据不好找,假设一个人确实患病(设为事件C, P(C)=0.04),他做PCR呈现阳性的概率为P(A|C)=0.95.   假设一个人没有得病(C’,事件C的补集),他做PCR呈现阴性的概率为P(A’|C’)=0.95  (根据诊所报告写的confidence level 0.95).

其中P(A|C)=0.95, P(C)=0.04, P(A|C’)=1-P(A|C)=0.05,  P(C’)=1-P(C)=0.96

所以如果新加坡在所有人群中普查,某人得到诊所诊断PCR呈现阳性,他真正得病的概率(P(C|A)由贝叶斯公式

P(C|A)=P(A|C)*P(C)/[P(A|C)*P(C)+P(A|C’)*P(C’)]=0.44

在回国人群中,因为都是是无症状的,如果PCR呈现阳性,真正得病得概率仅为0.44(理论上还要小,因为这个包含了有症状的那些人).  这就是为什么中国发现PCR阳性要反复确认。 
新加坡这里只要PCR阳性,马上发隔离令,这是不是也是一种简单粗暴和医疗资源浪费呢?
(这个模型比较粗糙,值得商榷,欢迎提供资料继续讨论)


3. 如果怀疑自己PCR是假阳,应该怎么办? 

其实我是来问这个问题的,医学手段上有什么方法可以确定的证明自己是PCR假阳,因为现在一旦PCR阳性,大使馆就要求康复三个月才能回去中国,如果是假阳,太耽误事情了。


参考资料:
1.   新加坡眼app文章. 狮城茶馆->《疑似新冠误诊,近期回国注意了》 11.8
2. 《概率论与数理统计》浙江大学第三版 



该帖荣获当日十大第8,奖励楼主4分以及6华新币,时间:2021-11-11 22:00:22。
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作者:sakuragi (等级:2 - 初出茅庐,发帖:446) 发表:2021-11-11 12:44:22  2楼
结论
不要去来福士。。。。去parkway做
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作者:sixsixsix (等级:2 - 初出茅庐,发帖:670) 发表:2021-11-11 13:09:10  3楼
结论不要去来福士。。。。去parkway做
忘记是哪里看的
pcr的检测方法本身就是有可能会出现假阳性,但可以从人为的角度尽量减少这方面的情况发生,完全100%准确的话应该是做不到。

raffles本身就不属于权威性很强的医院,私人医院里设施好但无口碑的(至少在华人这里),听朋友也说过它家对员工不是很好。
不知道大使馆为什么非要指定这家,虽然有自己的lab但它家是真的不太靠谱,本地人根本不会去的医院没有之一。

而且pcr假阳情况明明是检测机构的问题,却还是不许再测(或再测是阴性也不认),也就是说冤枉你了,你就忍着,别瞎逼逼。整一套的逻辑就是没有逻辑

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作者:dancingdoll (等级:2 - 初出茅庐,发帖:126) 发表:2021-11-11 14:07:51  4楼
楼主虽然知道贝叶斯公式但是似乎不懂生物和医学原理
1. PCR的结果是由cutoff cycle threshold (ct value)决定的,阴性阳性不是0 和1的关系,看看这篇科普文章就明白了。https://www.straitstimes.com/singapore/how-do-ct-values-and-serology-tests-tell-if-a-person-is-still-infectious
第二天比前一天病毒量增加,自然就会提前检测到因此结果变成阳性了。
2. 人体肯定是先有病毒,免疫系统才会产生反应生产出相应的抗体,这是需要时间的。因此PCR刚刚测出阳性抗体测试阴性很正常
3. ART的灵敏性远远不如PCR, 这也是为什么卫生部说没有症状的时候ART阳性可以直接确诊不需要再做PCR的原因。
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作者:dancingdoll (等级:2 - 初出茅庐,发帖:126) 发表:2021-11-11 14:08:17  5楼
忘记是哪里看的pcr的检测方法本身就是有可能会出现假阳性,但可以从人为的角度尽量减少这方面的情况发生,完全100%准确的话应该是做不到。 raffles本身就不属于权威性很强的医院,私人医院里设施好但无口碑的(至少在华人这里),听朋友也说过它家对员工不是很好。 不知道大使馆为什么非要指定这家,虽然有自己的lab但它家是真的不太靠谱,本地人根本不会去的医院没有之一。 而且pcr假阳情况明明是检测机构的问题,却还是不许再测(或再测是阴性也不认),也就是说冤枉你了,你就忍着,别瞎逼逼。整一套的逻辑就是没有逻辑
请问本地人去什么医院
麻烦推荐一下
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作者:漫漫长路 (等级:2 - 初出茅庐,发帖:43) 发表:2021-11-11 14:16:26  6楼
楼主虽然知道贝叶斯公式但是似乎不懂生物和医学原理1. PCR的结果是由cutoff cycle threshold (ct value)决定的,阴性阳性不是0 和1的关系,看看这篇科普文章就明白了。https://www.straitstimes.com/singapore/how-do-ct-values-and-serology-tests-tell-if-a-person-is-still-infectious 第二天比前一天病毒量增加,自然就会提前检测到因此结果变成阳性了。 2. 人体肯定是先有病毒,免疫系统才会产生反应生产出相应的抗体,这是需要时间的。因此PCR刚刚测出阳性抗体测试阴性很正常 3. ART的灵敏性远远不如PCR, 这也是为什么卫生部说没有症状的时候ART阳性可以直接确诊不需要再做PCR的原因。
感谢科普
但是网友2和网友4再测变阴性怎么解释呢?
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作者:dancingdoll (等级:2 - 初出茅庐,发帖:126) 发表:2021-11-11 14:23:56  7楼
感谢科普但是网友2和网友4再测变阴性怎么解释呢?
检测报告上应该有阳性信号是在第几个cycle出现的
如果非常接近CT值,那么就是比较模凌两可的结果
我不清楚新加坡的具体标准,猜测可能网友4前后的测试都比较接近CT值,刚好一个在前一个在后.
网友2只写了PCR先阴后阳没看到转阴
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作者:熊走瞧 (等级:1 - 微不足道,发帖:212) 发表:2021-11-11 14:38:19  8楼
楼主是数学达人生物不通,pcr 阳性就是阳性,
正确说法是抗体假阴性
已经有报道知道有些人有症状,pcr 阳性,xray 有肺炎表现, 可是仍然测不出抗体
这些人的免疫系统有问题
那些说什么实验室医院行不行的就更加chedan
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作者:熊走瞧 (等级:1 - 微不足道,发帖:212) 发表:2021-11-11 14:39:51  9楼
这些人想回国和大使馆穷对付,是痴心妄想
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作者:dancingdoll (等级:2 - 初出茅庐,发帖:126) 发表:2021-11-11 14:41:39  10楼
这些人想回国和大使馆穷对付,是痴心妄想
呵呵
大使馆可不是吃素的
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作者:Currant (等级:2 - 初出茅庐,发帖:189) 发表:2021-11-11 14:46:44  11楼
楼主是数学达人生物不通,pcr 阳性就是阳性,正确说法是抗体假阴性 已经有报道知道有些人有症状,pcr 阳性,xray 有肺炎表现, 可是仍然测不出抗体 这些人的免疫系统有问题 那些说什么实验室医院行不行的就更加chedan
概念和你说那个是两回事吧。
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作者:Currant (等级:2 - 初出茅庐,发帖:189) 发表:2021-11-11 14:47:12  12楼
楼主是数学达人生物不通,pcr 阳性就是阳性,正确说法是抗体假阴性 已经有报道知道有些人有症状,pcr 阳性,xray 有肺炎表现, 可是仍然测不出抗体 这些人的免疫系统有问题 那些说什么实验室医院行不行的就更加chedan
概率
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作者:Currant (等级:2 - 初出茅庐,发帖:189) 发表:2021-11-11 14:56:36  13楼
多次pcr或十四天后pcr,抽血,血清也
是阴。应该可以证明吧。只是如果大使馆不能灵活处理,执着僵硬文件也没办法。
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作者:Blzrd (等级:3 - 略知一二,发帖:5389) 发表:2021-11-11 15:00:39  14楼
多次pcr或十四天后pcr,抽血,血清也是阴。应该可以证明吧。只是如果大使馆不能灵活处理,执着僵硬文件也没办法。
最有力的证明就是时间,目前的设置是3个月,
虽然有各种办法也许可以证明,大使馆会take the risk吗。。。
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作者:tiantang (等级:2 - 初出茅庐,发帖:206) 发表:2021-11-11 16:55:09  15楼
我有朋友也是这种情况,但是大使馆不承认假阳性
最近有朋友的情况和你相似。起飞前,第一次核酸阴性,第二次核酸阳性( CT值,40多,),血清阴性,同住家人全部PCR阴性。为了自证清白,几天后约了上门检测,也是阴性。期间全家ART也都是阴性,后来诊所说CT值大于30就没有临床意义。大使馆不承认假阳性,一律按照阳性处理
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作者:tiantang (等级:2 - 初出茅庐,发帖:206) 发表:2021-11-11 17:12:32  16楼
最有力的证明就是时间,目前的设置是3个月,虽然有各种办法也许可以证明,大使馆会take the risk吗。。。
大使馆应该不会承担这个风险
因为大使馆最近发了一个通知,严禁多次测试直到阴性
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作者:NoGrabTaxi (等级:2 - 初出茅庐,发帖:537) 发表:2021-11-11 21:49:21  17楼
我就想问下
P(A|C’)=1-P(A|C)=0.05 是怎么来的?
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作者:TPMT (等级:8 - 融会贯通,发帖:3831) 发表:2021-11-12 02:22:38  18楼
楼主,你预设的几个概率没一个对的。
新加坡总人口545万(2021年6月公开数据),新冠总确诊数227681(2021/11/11新浪数据),所以估计目前患病比例为0.04.
>>> 病患比例不能等同于得病的概率。

以事件A表示PCR呈现阳性,以A’表示PCR呈现阴性(事件A的补集).  PCR检测准确率数据不好找,假设一个人确实患病(设为事件C, P(C)=0.04),他做PCR呈现阳性的概率为P(A|C)=0.95.   假设一个人没有得病(C’,事件C的补集),他做PCR呈现阴性的概率为P(A’|C’)=0.95
>>> 你定义的P(A|C)和P(A'|C')其实就是Sensitivity和Specificity。对于PCR技术,怎么可能是0.95?? 太低了。对于approved PCR-based IVD就算0.99都低了。

既然预设的数据都有问题,后面的计算就不用看了。
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作者:TPMT (等级:8 - 融会贯通,发帖:3831) 发表:2021-11-12 02:25:30  19楼
楼主虽然知道贝叶斯公式但是似乎不懂生物和医学原理1. PCR的结果是由cutoff cycle threshold (ct value)决定的,阴性阳性不是0 和1的关系,看看这篇科普文章就明白了。https://www.straitstimes.com/singapore/how-do-ct-values-and-serology-tests-tell-if-a-person-is-still-infectious 第二天比前一天病毒量增加,自然就会提前检测到因此结果变成阳性了。 2. 人体肯定是先有病毒,免疫系统才会产生反应生产出相应的抗体,这是需要时间的。因此PCR刚刚测出阳性抗体测试阴性很正常 3. ART的灵敏性远远不如PCR, 这也是为什么卫生部说没有症状的时候ART阳性可以直接确诊不需要再做PCR的原因。
PCR测的是抗原,也就是病毒的核酸序列。不是抗体。
准确的说,是RNA逆转录的cDNA。你说的第二条是完全错的。
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作者:TPMT (等级:8 - 融会贯通,发帖:3831) 发表:2021-11-12 02:27:36  20楼
PCR测的是抗原,也就是病毒的核酸序列。不是抗体。准确的说,是RNA逆转录的cDNA。你说的第二条是完全错的。
Sorry,可能我断句有问题。误读了楼主意思。
忽略此帖。
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