东京我去过的地方不多，不过东京塔是去过的，夜景蛮好看

京都可以去的寺庙太多太多啦，有点难以推荐，就交通方面给一些tips吧
清水寺离车站有一段十多二十分钟的上坡，如果正好撞到节假日人会非常拥挤可怕。带小朋友的话可以研究能不能直接打车上去，或者挑清晨人少的时候过去。否则会比较遭罪
金阁寺人也非常多，个人体验比清水寺还可怕一点。从京都站坐车过去可以顺路去看看二条城，或者从岚山回来刷。岚山小火车至少我觉得春季的风景soso，偶数座位ad看外面的风景最好。我去的樱花红叶季都是需要提前预定的
伏见稻荷大社入口的地方人会比较多，往里面走一走还好。不过后面山路比较多，走起来辛苦一些。顺说东福寺离这边挺近的，我个人还蛮喜欢的一处可以考虑一起去嗒

我听同事推荐过富士山的芝樱很漂亮，五月好像正好是花季

奈良我个人强推西之京那一片的古迹，如果过夜的话可以考虑抽半天时间去唐招提寺和药师寺，法隆寺我个人非常喜欢但交通不太便利。如果时间少那在奈良公园附近转转足够啦。东大寺感觉游人会比较多，建议时间安排上避开白天人潮最汹涌的时候。

大阪主要吃吃逛逛，听人反馈大阪城里面soso，在外面看看就好。