告诉他你想从哪里到哪里，几点左右。他会尽量安排独立座位给你。一个人的话会问你是否要窗口位，关键词mado（窗）。
http://www.jrpass.com/blogs/reserving-seats-boarding-the-bullet-train

你在三原是新干线换同一方向新干线吗？如果是的话，没问题。但最好指示牌显示三原然后听到关键词mamonaku(马上）后拿行李到车门等。如果是一般线换新干线，要上下电梯，可能时间不够。
无论如何，参考
http://www.hyperdia.com/en/
把你的起点终点时间输入，看显示路线的换乘（有显示月台）。基本上这网站说可以的话，就可以，售票处系统也能出票。