泰国国内也不乏反对建设运河的呼声。最大的理由是运河将导致反政府伊斯兰势力所在的最南部地区与国土割裂开来。临时政府总理巴育对运河计划一直持否定态度，称“最南部的问题尚未解决。现在不是考虑的时候”。