楼主感到不满也是应该的。
这时候其实最应该的是取得上司的理解与支持。
我之前有碰到下属因为是我直接面试招收的，结果老是越级向我汇报工作，我也不得不屡次明确告知必须先找line manager。如果上司在这种情况下不阻止越级汇报的话，确实是很麻烦的事情，相信大多数line manager都会感到棘手。